1月29日，学会组织召开“深化高等教育强国建设研究”咨询座谈会，来自教育部社科司、规划办，清华大学等单位的25位专家学者参会，探讨了新形势下深化高等教育强国研究等问题。
　　2月27日，学会第三届学术委员会第三次会议暨《中国高教研究》2016年编委会会议在华中科技大学召开，学会学术委员会委员及《中国高教研究》编委会委员等40余位专家学者参会。

　　3月，学会受教育部委托组织开展《中国高等教育现代化2030》（学术版）编撰工作，历时3个月完成主报告1份和专题观察报告13份，共计30余万字。
　　3月21—22日，由教育部思想政治工作司指导，保卫学专业委员会主办的第一届全国高校学生安全教育教学能力大赛决赛在武汉大学举行。
　　3月29—30日，学会在国家教育行政学院召开了学会系统2016年度秘书长工作会议。全国各省（市）区高教学会，行业高教学会，大学高教学会及各分支机构秘书长70余人参加了会议。
　　3月， 2016年度分支机构专项课题申报工作陆续启动。学会联合所属体育专业委员会，评审立项了体育专项课题50项；联合实验室管理工作分会，评审立项了实验室管理专项课题15项；联合教育信息化分会评审立项教育信息化专项课题43项，并陆续完成了开题工作。

　　4月6日，《高校理论与实践教学深度融合若干问题观察报告》《高校科研与教学深度融合若干问题观察报告》《高校信息技术与教学深度融合若干问题观察报告》《中国高校信息公开观察报告》列入教育部2016年度《中国教育报告·发展与质量》立项计划。
　　4月13日，学会联合光明日报社在京召开“高校科技成果转化”教育沙龙。
　　4月15—17日，学会在北京主办了“抓住教育教学关键问题，做好‘十三五’规划的编制实施”专题报告会，近百所高校近200人参会。
　　4月21—23日，大学素质教育研究分会在西安交通大学召开了“2016年年会暨第五届大学素质教育高层论坛”，400余名专家学者以及港台高校代表参会。
　　4月22日，工程教育专业委员会在浙江大学召开“换届大会暨工程科技人才培养研讨会”，浙江大学党委常务副书记邹晓东当选为理事长，本科生院常务副院长陆国栋当选为秘书长，107所高校被推选为第五届理事会理事单位。
　　4月27日，“高校实践教学改革与人才培养模式创新系列活动暨第47届全国高教仪器设备展示会”在合肥举行。来自全国30个省（市）区高校教学管理及一线教师共计1万余人参会，674家行业内代表性企业参展，展位数1639个，面积4.5万平方米，活动规模为历届之最。展会分高校教学改革与人才培养模式创新成果交流、高校实践教学改革与实验室建设研讨、现代教育装备展览展示三个板块，八大专题、九场报告和五大专展。

　　5月6—7日，“一流大学本科教学高峰论坛”在厦门大学举办。教育部副部长林蕙青、学会会长瞿振元等领导出席会议。来自全国近百所“985工程”“211工程”等高校的校长、主管教学工作的副校长、教学管理人员及研究人员共270余人与会。
　　5月12—14日，学会在北京举办了“全面提升质量管理水平，全面提高教学综合改革成效”专题报告会。会议围绕高校理论知识传授与实践教学深度融合、科研创新与教学育人深度融合、信息技术与教育教学深度融合进行了交流和研讨，150余人参会。
　　5月18—21日，学会秘书处组织实验室建设与管理方面的专家赴新疆送教。新疆13所本科院校的教务处长、实验室与设备处处长等100多名代表参加了专题培训。
　　5月27日，“高等教育信息化校长高峰论坛”在北京联合大学举办。瞿振元会长、教育部科技司领导以及全国70余所高校校长和主管信息化工作副校长等200余人参会。
　　5月27—30日，学会工程热物理专业委员会在哈尔滨工程大学举行了换届大会，同时举办了第22届全国学术会议暨全国工程热物理博士后论坛。大连理工大学沈胜强当选为理事长，天津大学尧命发当选为秘书长，来自60余所高校300余人参会。

　　6月—12月,学会联合中华全国学生联合会、中国青年报社完成了“2016年学生喜爱的大学校长”推选活动。四川师范大学丁任重等36名校长获得“2016年学生喜爱的大学校长”称号。上海工程技术大学等36个制作团队获“最佳原创微视频制作团队”。
　　6月8日，举行了由中国高等教育学会、中国传媒大学、新浪微博等联合主办的第14届“半夏的纪念——北京（国际）大学生影像展”颁奖会。
　　6月17日，廉政建设分会成立大会暨学术研讨会在北京师范大学召开。中央纪委监察部驻教育部纪检组原副组长、监察局原局长李胜利当选为分会第一届理事长，清华大学校务委员会副主任韩景阳当选为秘书长，80余人参会，瞿振元会长等出席会议。
　　6月24日，学会分支机构秘书长2016年第二次工作会议在国家教育行政学院召开，70余位秘书长参加了会议。
　　6月25—30日，学会秘书处组织第三次专家团赴西藏高校进行调研和送教。此次活动主要是推广2014年国家级教学成果奖获奖成果，宣传2015年“万人计划”教学名师，以及捐赠优秀图书资料。
　　6月26—28日，“产教融合推进实践教学改革专题报告会暨浙江宁波现场会”在浙江万里学院举行，会议围绕产教融合、校企合作人才培养等问题进行研讨，来自全国近百所高校180余人参会。
　　6月30日，学会通过了民政部2016年年检工作。

　　7月11日，印发《中国高等教育学会关于将高校技术物资中心更名为事业发展部的通知》（高学会〔2016〕70号），学会秘书处“高校技术物资中心”更名为“事业发展部”。
　　7月14—16日，“2016年中国高等教育学会系统主办刊物负责人研讨会”在东莞理工学院召开。会议以“交流办刊经验，提升办刊水平”为主题，来自30多家高水平核心期刊负责人共50余人参会。
　　7月20日，数学教育专业委员会第三届三次理事会暨2016年学术年会在贵阳召开，200余人参会。
　　7月25—31日，“高校科研与教学深度融合专题报告会” “依托信息技术，做好课程建设及教学设计专题报告会”“落实国家战略部署，加强高校大数据管理与应用专题报告会”在贵阳举办，累计近400名高校领导及骨干教师参加会议。
　　7月29日，高教管理分会在新疆石河子大学召开2016年学术年会，来自全国高校200多位代表参加了会议。

　　8—12月，《致青春路上的你——大学校长2016年开学典礼演讲精选》《致成长路上的你——大学校长2016年毕业典礼演讲精选》完成编撰。丛书精选了129 所大学校长在2016年开学典礼和毕业典礼上的讲话，2017年1月由中国青年出版社出版。
　　8月1日，实验室管理工作分会在北京大学召开第七次会员代表大会，北京大学副教务长、党委组织部部长严纯华当选为分会新一届理事长，北京大学实验室与设备管理部部长张新祥当选为秘书长。
　　8月13日，教学研究分会在扬州大学举行“第四届理事大会暨教学改革研讨会”，高等教育出版社总编辑、全国高等学校教学研究中心常务副主任杨祥当选为分会新一届理事长，全国高等学校教学研究中心教学研究室主任吴博当选为秘书长。
　　8月27日，思想政治教育分会在北京召开第八次会员代表大会暨第三届思想政治教育创新发展学术研讨会，学会瞿振元会长等参加会议并讲话。北京师范大学党委书记刘川生当选为理事长，北京师范大学党委副书记李晓兵当选为秘书长。

　　9月，学会高等教育科学研究“十三五”规划课题，自4月启动申报工作后，组织专家评审出重大攻关课题11项，重点调研课题25项，一般课题164项，经公示立项。学会给予“十三五”规划课题的科研经费支持额度创历史新高，预计达到260万元。
　　9月，为完成教育部高教司委托任务，学会组织上海交通大学等高校有关专家，对74所教育部直属高校的“十三五”规划进行评价，形成测评报告。
　　9月，为落实学会与英国高等教育学会签署的合作备忘录，学会组团赴英国高等教育学会进行访问。双方围绕共同开发教师资格框架及证书、教师教学能力培训、合作工作方式等专题进行深入讨论。
　　9月27—29日，美育专业委员会2016年学术年会在杭州师范大学召开，会议研讨了如何开展高校的美育工作以及构建高等学校美育工作评价标准，美育课程体系建设，100多名专家学者、美育工作者参会。

　　10月，学会完成第十二届“高等教育学”优秀博士学位论文评选。经征选、通讯评审、会评工作，最终评选出 5篇优秀博士学位论文和5篇提名奖论文。
　　10月，《中国高等教育学会改革发展专题观察报告（2015年）》完成组编，由北京理工大学出版社出版。报告旨在反映学会分支机构所在管理领域和学科专业领域改革实践的新进展、新成效、新经验，15个分支机构参与了观察报告的撰写。
　　10月，《2015年教育部直属高校及部分地方本科高等学校信息公开动态测评观察报告》以内部资料的形式印发，发送相关高校并报部领导参阅。
　　10月10日，经过公开招投标，学会与国药励展展览有限责任公司就承办“2017—2020年全国高教仪器设备展示会” 签约。
　　10月19—21日，学会“高校实践教学改革与人才培养模式创新系列活动暨第48届全国高教仪器设备展示会”在成都举行。共举办19个论坛，120场报告，中国工程院段宝岩等4名院士，及来自全国30个省（市）区高校教学管理人员、实验实训管理人员、一线教师共计1万余人参会。参展、参会规模均创秋季展会历史新高。展会期间，举办了“第四届高等学校自制实验教学仪器设备评选及优秀作品展示活动”，来自110所高校的235个作品参展，评审出一等奖13个，二等奖41个，三等奖220个，团体奖20个。
　　10月21—23日，由职业技术教育分会、江苏省高等职业教育研究会主办了以“深化职业教育改革，服务学生成长人才”为主题的第四届海峡两岸高等职业教育校长联席会议学术年会。台湾地区21所院校、大陆46所高职院校代表以及11家大陆和台湾地区优秀企业负责人参加了大会。
　　10月26日，学会联合中华职教社、教育部在线教育研究中心、慧科集团、学堂在线共同举办的“2016中国高等教育创新大会”在国家会议中心举行。会议围绕中国高等教育创新之路、“互联网+”时代的产教融合、高等教育国际合作共赢新趋势等主题进行了讨论，3000余位代表参会。
　　10月28日，学会在南宁召开中国高等教育学会第六届理事会第八次会议。瞿振元会长做了工作报告，康凯秘书长做了财务报告。11月4—12日以通讯方式举行了线上会议。11月17日，学会印发了《中国高等教育学会第六届理事会第八次会议决议》。
　　10月28—30日，“2016年中国高等教育学会学术年会暨高等教育国际论坛”在广西南宁举办，论坛主题为：“学生·教师·课堂：高等教育现代化”。教育部林蕙青副部长出席会议并做重要讲话。来自全国高校和科研机构的领导、专家学者、教育行政部门领导，高等教育学博士生，来自美国、英国、瑞典、澳大利亚以及香港、澳门、台湾地区的专家学者、新闻媒体等1000余人参加了论坛。论坛同期召开博士生专题论坛暨博士生导师报告会。论坛由广西高等教育学会、广西大学承办，并得到广西教育厅、北京航空航天大学高教所、广西外国语学院、南宁学院的大力支持。会后出版了《2016年中国高等教育学会学术年会暨高等教育国际论坛文集》。

　　11月，学会报送的《建设高等教育强国》获教育部“第五届全国教育科学研究优秀成果”著作类一等奖。
　　11月2—3日，学会作为大陆民间团体之一，参与了由海峡两岸20家民间团体在北京共同主办的“两岸和平发展论坛”。来自两岸社会各界代表、社会精英、社团负责人等约200多人出席论坛。论坛聚焦政治互信、经济合作、文化传承、民间交流、关注青年等主题。
　　11月7—9日，学会与中国科协新技术开发中心、四川博览事务局、成都市人民政府在成都联合主办了主题为“科技创新，育见未来”的“2016亚洲教育论坛”。就科技创新、职业教育、“互联网＋”教育、创意教育、青少年成长与可持续发展等热点议题研讨交流，并发布《共建“一带一路”教育行动成都宣言》。来自30多个国家和地区800多名各界嘉宾出席论坛。
　　11月9日，中国高等教育学会与光明日报社在北京工业大学联合举办“学科评估与学科建设”沙龙。
　　11月9—10日，校友工作研究分会在复旦大学召开第四届会员代表大会暨全国高校校友工作第23次研讨会。浙江大学罗卫东副校长当选分会新一届理事长，胡炜当选分会常务副理事长兼秘书长。360余位与会代表研究探讨了高校校友工作。
　　11月10日，中外合作办学研究分会在郑州召开成立大会暨第一次会员代表大会。厦门大学中外合作办学研究中心主任林金辉当选研究分会理事长，集美大学文学院党委副书记陈娟当选为副理事长兼秘书长，150多人出席了大会。
　　11月11—13日，第二届全国高等院校工程应用技术教师大赛在浙江大学举行。106所高校的211名选手入围决赛。评审出一等奖25名、二等奖54名、三等奖67名和决赛入围奖53名及31个优秀组织奖。
　　11月11—13日，由学会、中国发明协会、中国教育技术协会共同主办的第八届高等学校信息技术创新与实验活动决赛在无锡举行。来自全国百余所高校800余名大学生参加了数字艺术类、创客创新类、师范创新类等三大类八个赛项，共决出一等奖81人、“未来教师”荣誉称号2人、活动最高奖项“恩欧希教育信息化发明创新奖”1组。
　　11月14日，在国家卫生计生委、教育部等共同指导下，学会作为联合承办单位之一，参与了在北京航空航天大学举办的2016年世界艾滋病日主题宣传暨《我是大医生》特别节目活动。活动特别邀请了世界卫生组织艾滋病/结核病防治亲善大使、国家卫生计生委预防艾滋病宣传员彭丽媛教授出席。
　　11月22—26日，学会高等教育科学研究“十三五”规划重大、重点课题开题会分别在上海和北京召开，36项重大攻关课题和重点调研课题负责人参会。
　　11月27日，学会主办的第八届全国大学生广告艺术大赛颁奖典礼暨第九届全国大学生广告艺术大赛启动仪式在北京全国政协礼堂举行。

　　12月16日，师资管理研究分会在海南大学召开第八次会员代表大会暨学术年会，北京大学校长林建华当选为第八届理事长，北京大学人事部部长刘波当选为秘书长，来自120多所高校230余名代表参会。
　　12月，学会申请的国家社科基金重大招标项目“高等教育强国的内涵、标准、实现路径及监测指标”，获批准立项。
　　12月，学会向教育部教师司申报的“中国高校教师教学能力专业化发展调研”课题获批准立项。
　　12月2—4日，学会与西南大学、南京理工大学联合主办的“2016年高等学校动商与教育发展论坛”在西南大学召开，论坛围绕“动商与学校教育、青少年体质、核心素养、国民素质、人才培养、职业技能”等主题展开探讨，83所高校的145位代表参会。
　　12月8—9日，教育信息化分会、吉林大学、长春理工大学、长春工业大学在长春共同主办了2016年高校网络信息安全学术年会，南京铱迅信息技术股份有限公司协办，近300人参加了会议。
　　12月10日，体育分会主办的第八届中国学校体育科学大会在广州体育学院召开，来自各省、区、市的教育行政部门，教育科研、教研机构和高校、中小学体育卫生教师800多人参加会议。
　　12月17日，薪酬管理研究分会年会在四川省成都市召开。来自教育部人事司、四川大学、四川省教育厅等领导及129个单位的300多名代表参会。
　　12月17—18日，音乐教育专业委员会第七届常务理事会及秘书长工作会议在清华大学艺术教育中心举行。来自24所大学的26位分会理事长、副理事长、秘书长等参加了会议。
　　12月22日，学会与中华中山文化交流协会、两岸文化创意人才服务基地共同主办的第三届“华灿奖”颁奖仪式暨第七届两岸青年创新创业论坛在北京举行，全国政协副主席、民革中央常务副主席齐续春，国台办副主任龙明彪，全国政协常委、民革中央副主席郑建邦，学会会长瞿振元，教育部高教司司长张大良等出席颁奖仪式，两岸各界200余位嘉宾参会。
　　12月25—27日，引进国外智力工作分会2016年会在复旦大学召开。150多所高校的230名代表深入学习贯彻教育对外开放新精神，研讨凝聚新时期教育外事工作发展共识。
　　12月26日，受教育部高教司委托，学会具体实施的2016年高通公司产学合作协同育人项目，在海口召开专家评审会，评出立项项目25项，包括重点项目5项、一般项目20项。
　　截至12月底，除4家有独立银行账号的分支机构外，学会下属60家分支机构的财务移交总会管理，学会基本完成了民政部要求的财务管理移交工作。

　　2016年，学会完成了内部控制基础性评价工作。到12月底，拟定和完善了《中国高等教育学会高等教育科学研究项目经费管理办法》《中国高等教育学会外部课题经费管理办法》等20多个制度，学会内控制度建设基本完成。
　　2016年，学会完成了对《中国现代教育装备》杂志社存在的问题等多项整改任务，有的得到部领导的充分肯定。
　　2016年，学会及秘书处获得多项殊荣：学会获得全国教育科研管理先进单位；范笑仙的家庭荣获全国妇联组织开展的“2016全国最美家庭”称号。秘书处多位同志、部门和专项工作获得中共教育部直属机关党委会的表彰。　　
　　截至12月底，学会微信公众平台共推送信息275条，关注人数16683人，比2015年增加9037人。
　　截至12月底，学会门户网站发布信息206条，网站浏览量23.3万次，投稿平台浏览量16.2万次。
　　2016年，学会出版24期《中国教育科研参考》。
　　2016年《中国高教研究》继续保持高质量，在国内几大期刊评价系统排名中名列前茅。①《中国高教研究》荣获“2016中国国际影响力优秀学术期刊”。在《中国学术期刊国际引证年报》（2016版）遴选出的60种人文社科期刊（TOP5%~TOP10%）中排名第4位。②在《中文社会科学引文索引（CSSCI）来源期刊和收录集刊（2017—2018）目录》中，《中国高教研究》在高等教育学类期刊中排名第4位。③在2016年《中国学术期刊影响因子年报（人文社会科学）》中，《中国高教研究》期刊影响力指数及影响因子在G4/G7教育245种期刊中排名第8位。④2016年3月29日，被人大书报资料中心评为“复印报刊资料”重要转载来源期刊；在人民大学书报资料复印中心《教育学文摘》2015年的转载排名中位列第一。⑤入选《中国学术期刊评价研究报告（武大版）（2017—2018）》（第5版）326中A+期刊，在教育学11家期刊中排名第8，高等教育类排名第2位。⑥2015年版北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》G64高等教育类排名第2位。